Correlation of TOP2A with prolifera

Correlation of TOP2A with proliferation composite scores
and prognostic influence in breast cancer subgroups. In
previous studies, TOP2A was shown to be prognostic in
estrogen receptor–positive but not in estrogen receptor–negative
breast carcinomas (25). In addition, ERBB2-positive and
triple-negative carcinomas are often considered as a separate
class of breast cancer (26). To obtain a clearer view on the
prognostic relationship between TOP2A and ERBB2, we
applied PCA. The relative gene expression levels of TOP2A
and ERBB2, as well as time to distant metastasis, were visualized
in a PCA plot of 194 breast cancer samples (Mainz
cohort; Supplementary Fig. S4A-C). Additionally, breast
cancer molecular subgroups, defined by gene expression
of ESR1 and ERBB2 (ESR1+/ERBB2- = luminal like,
ERBB2+, and ESR1-/ERBB2- = basal like), were visualized
in the same PCA plot to show the relationship among
these subtypes, TOP2A gene expression, and patient
outcome (Supplementary Fig. S4D).
In contrast to TOP2A, ERBB2 RNA was not significantly
associated with outcome in the analyzed breast cancer
data set. This might be expected, given the fact that triplenegative
tumors have a high TOP2A, a low ERBB2 expression,
and an adverse outcome (Supplementary Fig. S4).
However, ERBB2-positive tumors display a relative high expression of TOP2A (Supplementary Fig. S4A, D) and
other proliferation-associated genes and, as a group, have
a similar poor prognosis as triple-negative samples. The
group-wise analysis showed that TOP2A was significantly
associated with the MFI in estrogen receptor–positive and
ERBB2-negative carcinomas and as soon as the triplenegative
carcinomas were excluded (Table 1B). ERBB2
was significantly associated with the MFI in estrogen receptor–positive
and as soon as triple-negative carcinomas
(high TOP2A RNA levels) were excluded (Table 1C).
Composite scores of a variable number of proliferationassociated
genes have been shown to have a strong relevance
to the outcome (27, 28). Therefore, we analyzed
the correlation between TOP2A, MKI67 and two composite
scores consisting of AURKA, BIRC5, MYBL2, MKI67,
and CCNB1 (score 1) and RACGAP1, NEK2, CENPA,
RRM2, and BUB1B (score 2), and compared their prognostic
performance by univariate and bivariate Cox regression
analysis in the cohort of node-negative patients who did
not receive systemic adjuvant therapy (Supplementary
Tables S3 and S4). The analyzed parameters correlated
significantly with each other (Supplementary Table S3).
However, the correlation coefficient was highest between
the two composite scores (r = 0.91) and lowest between
the two single genes TOP2A and MKI67 (r = 0.65). Univariate
Cox regression revealed that all parameters were highly
significantly associated with the development of distant
metastasis (Supplementary Table S4A). Significance levels
were even higher, despite a smaller sample size, when the
analysis was restricted to ESR1 positive and ERBB2 negative,
which is in line with the observation from the subgroup
analysis (Supplementary Table 4B). In this cohort,
both composite scores did similarly and better than each
of the individual genes alone. Consequently, the composite
scores but not TOP2A remained significant in bivariate
Cox regression analysis, showing that the prognostic
power of the composite scores is not only higher but the
information of TOP2A is contained within the scores
(Supplementary Table S4C). Interestingly, TOP2A and
MKI67 both remained significant in bivariate Cox regression,
indicating that despite relatively high correlated
expression, both genes contain independent prognostic
information (Supplementary Table S4C).

Результаты (русский) 1:

Соотношение TOP2A с распространением композитный баллови прогностические влияние в подгруппах рака молочной железы. Впредыдущие исследования, TOP2A было показано, что прогностическая вэстроген рецептор положительным но не в эстроген рецептор отрицательныйкарциномы груди (25). Кроме того, ERBB2-положительных итройной негативного карциномы часто рассматриваются как отдельныйкласс рака молочной железы (26). Чтобы получить более четкое представление оПрогностические отношения между TOP2A и ERBB2, мыприкладной PCA. Уровни выражения относительной гена TOP2Aи визуализировать ERBB2, а также время для отдаленных метастазов,в участке PCA 194 образцов рака молочной железы (Майнцкогорты; Дополнительные рис. S4A-C). Кроме того грудимолекулярные подгруппы рака, определяется выражение генаESR1 и ERBB2 (ESR1 +/ ERBB2 - = Люминал,ERBB2+ и ESR1-/ ERBB2 - = базальной как), были визуализированав же PCA заговор чтобы показать отношения междуэти подтипы, TOP2A экспрессии генов и пациентрезультат (дополнительные рис. S4D).В отличие от TOP2A ERBB2 РНК не была значительносвязанные с исходом в анализируемом молочной железынабор данных. Это можно было бы ожидать, учитывая тот факт, что triplenegativeопухоли имеют высокий TOP2A, низкий выражение ERBB2,и неблагоприятный исход (дополнительные рис. S4).Однако, ERBB2-позитивных опухолей отображать относительные высокая экспрессия TOP2A (дополнительный рис. S4A, D) идругих генов, связанных с распространением и, как группы,аналогичных плохой прогноз как тройной негативного образцы. ВGroup-Wise анализ показал, что TOP2A была значительносвязанные с MFI в эстроген рецептор положительным иERBB2-отрицательных карциномы и как можно скорее triplenegativeкарциномы были исключены (таблица 1B). ERBB2был значительно связан с MFI в эстроген рецептор положительными как можно скорее тройной негативного карциномы(высокий уровень TOP2A РНК) были исключены (таблица 1 c).Композитные десятки переменное количество proliferationassociatedбыло показано, что гены имеют сильное отношениерезультаты (27, 28). Таким образом мы проанализироваликорреляция между TOP2A, MKI67 и два композитаоценки, состоящий из AURKA, BIRC5, MYBL2, MKI67,и CCNB1 (Оценка 1) и RACGAP1, NEK2, CENPA,RRM2 и BUB1B (2 балла) и сравнить их прогностическаяпроизводительность от одномерных и двумерных Кокс регрессиианализ в когорте узел негативных пациентов, кто сделалне получать системные адъювантной терапии (дополнительныеТаблицы, S3 и S4). Проанализированы параметры коррелируютзначительно друг с другом (дополнительные таблицы S3).Однако коэффициент корреляции был высоким междудве составные оценки (r = 0,91) и низкие междудве односпальные генов TOP2A и MKI67 (r = 0,65). ОдномерныхКокс регрессии показали, что все параметры были весьмазначительно связанные с развитием отдаленныхметастазы (Дополнительная таблица S4A). Значение уровнябыли даже выше, несмотря на меньший размер выборки, когдаанализ был ограничен ESR1 положительные и отрицательные, ERBB2который соответствует наблюдения из подгруппыанализ (Дополнительная таблица 4B). В этой когорты,Обе композитный баллов сделал точно так же и лучше, чем каждыйтолько отдельных генов. Следовательно композитоценки, но не TOP2A по-прежнему значительным в двумерныхКокс регрессионного анализа, показывающие, что прогностическаямощность композитный баллов не только выше ноИнформация о TOP2A содержится в рамках оценки(Дополнительная таблица S4C). Интересно, что TOP2A иMKI67 оба остались значительные в двумерных Кокс регрессии,указанием что, несмотря на относительно высокие коррелированныхвыражение, как гены содержат независимых прогностическаяинформация (S4C дополнительные таблицы).

Результаты (русский) 2:

Корреляция top2a с композитными пролиферация баллов
и прогностического влияния на рак молочной железы подгрупп. В
предыдущих исследованиях, top2a было показано, что прогностический
эстроген рецептор-положительным , но не в эстроген рецептор-отрицательных
карцином молочной железы (25). Кроме того, ERBB2-положительных и
тройной негативный рак часто рассматривается как отдельный
класс рака молочной железы (26). Для того, чтобы получить более четкое представление о
прогностической взаимосвязи между top2a и ERBB2, мы
применены PCA. Относительные уровни экспрессии генов top2a
и ERBB2, а также время до отдаленными метастазами, визуализировали
в PCA участке 194 образцов рака молочной железы (Mainz
когорты;. Дополнительный рисунок S4A-C). Кроме того, рак молочной
железы, молекулярные подгруппы определяется экспрессии генов
из ESR1 и ERBB2 (ESR1 + / ERBB2- = просветная как,
ERBB2 + и ESR1- / ERBB2- = базальная подобное), визуализировали
в том же самом участке PCA , чтобы показать взаимосвязь между
этим подтипы, top2a экспрессии генов, и пациент
исходом (Дополнительный рис. S4D).
в отличие от top2a, ERBB2 РНК существенно не
связан с исходом в рак молочной железы проанализирован
набор данных. Это можно было бы ожидать, учитывая тот факт , что triplenegative
опухоли имеют высокую top2a, выражение низкой ErbB2,
и неблагоприятный исход (Дополнительный рис. S4).
Тем не менее, ErbB2-позитивных опухолей отображать относительную высокую экспрессию top2a (Дополнительный Рис. S4A , D) , и
другие пролиферации генов , ассоциированных и, как группа, имеют
такой же плохой прогноз как тройной отрицательных образцов.
Группа-накрест анализ показал , что top2a был значительно
связан с MFI в эстроген - рецептор-позитивных и
ERBB2-отрицательных карцином и как только triplenegative
карцином были исключены (таблица 1Б). ERBB2
был в значительной степени связано с MFI в эстроген - рецептор-позитивных
и как только тройной негативный рак
(высокие уровни top2a РНК) были исключены (Таблица 1C).
Составные десятки переменного числа proliferationassociated
генов было показано, имеют сильную актуальность
к результату (27, 28). Таким образом, мы проанализировали
корреляцию между top2a, MKI67 и двух композитных
баллов , состоящих из AURKA, BIRC5, mybl2, MKI67,
и CCNB1 (1 балла) и RACGAP1, NEK2, CENPA,
RRM2 и bub1b (оценка 2), и сравнили их прогностическое
выступление моновариантного и двухмерного Cox регрессионного
анализа в когорте лимфоузлов пациентов, так и
не получавших системную адъювантной терапии (дополнительные
таблицы S3 и S4). Анализируемые параметры коррелировали
значительно друг с другом (Дополнительная таблица S3).
Тем не менее, коэффициент корреляции был самым высоким между
двумя композитными баллов (г = 0,91) и самые низкие между
двумя одиночными генами top2a и MKI67 (г = 0,65). Одномерный
Кокс регрессии показал , что все параметры были высоко в
значительной степени связано с развитием отдаленного
метастазирования (Дополнительная таблица S4A). Уровни значимости
были еще выше, несмотря на меньший размер выборки, когда
анализ был ограничен ESR1 положительным и отрицательным ERBB2,
который находится в соответствии с замечанием из подгруппы
анализа (Дополнительная таблица 4В). В этой группе,
как композитные оценки сделали так же и лучше , чем каждый
из одних только отдельных генов. Следовательно, композиционный
оценки , но не top2a оставались статистически значимыми в двумерную
Кокс регрессионного анализа, показывающий , что прогностическим
мощность композитных показателей не только выше , но
информация о top2a содержится в баллами
(Дополнительная таблица S4C). Интересно, что top2a и
MKI67 оба остались значимыми в двухмерного регрессии Кокса,
указывая , что , несмотря на относительно высокую коррелировала
экспрессии, оба гена содержат независимую прогностическую
информацию (дополнительную таблицу S4C).

Результаты (русский) 3:

соотношение top2a с распространением сводные показателии прогнозирования влияния в рак груди подгрупп.впредыдущие исследования показали, top2a для предсказания вэстроген - – позитивный, но не в эстроген - – негативныегруди карциномы (25).кроме того, erbb2 позитивные итройной негативный карциномы зачастую рассматриваются в качестве отдельногокласс рак молочной железы (26).чтобы получить более четкое представление опрогнозный характер взаимосвязи между top2a и erbb2 мыприменяется в спс.относительный уровень top2a экспрессии генови erbb2, а также время для отдаленных метастазов, были отображеныв спс, участок 194 рак молочной железы образцов (майнцкогорта; дополнительные. s4a-c).кроме того, молочной железырак молекулярной подгрупп, определяется экспрессии геновиз esr1 и erbb2 (esr1 + / erbb2 - = luminal как,erbb2 +, и esr1 - / erbb2 - = базально - как), были отображеныв том же пптс заговор, чтобы показать взаимосвязь междуэти подтипы, top2a экспрессии генов, и пациентрезультат (дополнительные. s4d).в отличие от top2a, существенно не erbb2 рнкв связи с результатом в проанализированных рак молочной железынабор данных.это можно было ожидать, учитывая тот факт, что triplenegativeопухоли имеют высокий top2a, низкий erbb2 мнений,и отрицательные результаты (дополнительные диаграмма S4).однако, erbb2 позитивные опухоли отображения относительно высокие слова top2a (дополнительные. s4a, d) идругого оружия, связанного гены и, как группы,аналогичный неблагоприятный прогноз, как тройной негативные образцы.советгруппа мудрецов, анализ показал, что top2a существеннов связи с мфо в эстроген - – позитивных иerbb2 негативных карциномы и после того, как triplenegativeкарциномы исключаются (таблица 1b).erbb2был в значительной степени связана с мфо в эстроген - – позитивныеи как только три негативных карциномы(высоким top2a рнк уровнях) были исключены (таблица 1).сводные показатели переменной числа proliferationassociatedгены были показаны на сильную отношениев итоговом документе (27, 28).таким образом, мы анализироваливзаимосвязь между top2a, mki67 и двух составныхмногие из aurka, birc5, mybl2, mki67,и ccnb1 (балл 1) и racgap1, nek2, cenpa,rrm2, и bub1b (счет 2), и, как и их прогнозированияработы унивариантные и значения кокс регрессиианализ в когорте узел негативных пациентов, которые нене получать системные вспомогательной терапией (дополнительныев таблицах S3 и S4).этот анализ параметры коррелируютсущественно друг с другом (дополнительная таблица S3).вместе с тем коэффициент корреляции между был высокийдве сводные показатели (r = 0,91) и низкой междудве отдельные гены top2a и mki67 (r = 0,65).унивариантныекокс регрессии, показали, что все параметры были весьмав значительной степени связана с развитием далекихметастаз (дополнительная таблица s4a).значение уровнябыли даже выше, несмотря на небольшой размер выборки, когдаанализ был ограничен esr1 позитивные и негативные erbb2,что соответствует наблюдения из подгруппыанализ (вспомогательной таблице 4b).в этой когорте,так же и сводные показатели не лучше, чем каждыйиз отдельных генов в одиночку.таким образом, композитныхмногие, но не top2a остается значительным в значениякокс регрессионный анализ, показывает, что предсказаниявласти сводные показатели не только выше, ноинформация содержится в десятки top2a(дополнительная таблица эс - фор - си).интересно, что top2a иmki67 как остается значительным в значения кокс регрессияо том, что, несмотря на сравнительно высокую корреляциюслова, как гены содержат независимых предсказанияинформация (дополнительная таблица эс - фор - си).