Although more extensive studies inv

Although more extensive studies involving larger sam-
ple sizes and multiple life stages are needed to more
precisely assess the relative contribution of INDELs and
nucleotide differences to human-chimpanzee differences
in gene expression, the preliminary analyses presented
herein and previously reported by Khaitovich et al. [31]
indicate that both classes of genetic variation contribute
significantly to differences in patterns of gene expression
between the two species, especially in testis.
The fact that most of the human-chimpanzee INDEL
variation that correlates with differences in gene expres-
sion is attributable to HIs is interesting for two reasons.
First, it is consistent with the considerable body of
evidence suggesting that much of the divergence in gene
expression between chimpanzees and humans may have
been driven by accelerated regulatory evolution within
the human lineage [35-39]. Our results are consistent
with the hypothesis that an accelerated rate of INDELs
(predominately RT insertions) within the human lineage
may also have contributed significantly to the regulatory
differences between these two species. Second, our data
suggest that, at least with respect to the evolutionary
contribution of INDELs to chimpanzee-human diver-
gence in gene expression, selection operating on de novo
mutations (for example, insertions that occurred after
the divergence of the two species from a common
ancestor) may have been more important than selection
operating on standing INDEL variation preexisting in
common ancestral populations. This second conclusion
is contingent on the generally held presumption that
transposition rates in humans and chimpanzees are
approximately equal. Whereas previous analyses of gene
expression and protein-coding sequence variation
between chimpanzees and humans have revealed a pat-
tern consistent with neutral evolution and negative
selection [31], our findings are consistent with the
hypothesis that INDELs in general, and RT insertions
within the human lineage in particular, have been a
positive driving force behind human regulatory
evolution.

Результаты (русский) 1:

Хотя более обширные исследования с участием крупных Сэм -PLE размеров и нескольких этапов жизни необходимы болееточно оценить относительный вклад INDELs инуклеотид различия для человека шимпанзе различияв выражении гена представил предварительные анализыздесь и ранее сообщалось, Khaitovich et al. [31]Указывает, что оба класса генетической вариации вносятзначительно для различий в моделях экспрессии геновмежду двух видов, особенно в яички.Тот факт что большинство INDEL человека шимпанзевариации, что коррелирует с различиями в ген Экспрес-Сьон объясняется его интересным по двум причинам.Во-первых это согласуется с значительный объемдоказательств того, что большая часть расхождение в Геневозможно, выражение между шимпанзе и людейбыло обусловлено ускоренного нормативной эволюции в течениелинии человека [35-39]. Наши результаты согласуютсяс гипотезой, что ускоренный курс INDELs(преимущественно RT вставок) в пределах линии человекаможет также способствовали регулированияразличия между этими двумя видами. Во-вторых, наши данныепредполагают, что, по крайней мере в отношении эволюциивклад INDELs в шимпанзе человека дайвер-Гянджи в экспрессии генов, выбор, работающих на de novoмутаций (например, вставки произошедших послерасхождение двух видов от общегоancestor) may have been more important than selectionoperating on standing INDEL variation preexisting incommon ancestral populations. This second conclusionis contingent on the generally held presumption thattransposition rates in humans and chimpanzees areapproximately equal. Whereas previous analyses of geneexpression and protein-coding sequence variationbetween chimpanzees and humans have revealed a pat-tern consistent with neutral evolution and negativeselection [31], our findings are consistent with thehypothesis that INDELs in general, and RT insertionswithin the human lineage in particular, have been apositive driving force behind human regulatoryevolution.

Результаты (русский) 2:

Несмотря на более обширные исследования с участием более крупных образ-
размеров PLE и многоступенчатое жизни необходимы для более
точной оценки относительного вклада вставкам и
нуклеотидных различий в человеческой-шимпанзе различия
в экспрессии генов, предварительные анализы представлены
здесь , и ранее сообщал Khaitovich и др. [31]
показывают , что оба класса генетической изменчивости способствуют
значительно различий в характере экспрессии генов
между этими двумя видами, особенно в семенниках.
Тот факт , что большая часть INDEL человек-шимпанзе
вариации , которая коррелирует с различиями в гене выразительности
чайность приходящаяся к своему интересен по двум причинам. во-
первых, это согласуется со значительным телом
данных , свидетельствующих о том , что большая часть дивергенции в генной
экспрессии между шимпанзе и человеком , возможно,
был обусловлен ускоренным развития механизмов регулирования в пределах
человеческого рода [35-39]. Наши результаты согласуются
с гипотезой о том , что повышенная скорость вставкам
( в основном , RT встройки) внутри человеческого рода ,
возможно , также внесли значительный вклад в регуляторных
различий между этими двумя видами. Во- вторых, наши данные
свидетельствуют о том , что, по крайней мере , в отношении эволюционного
вклада вставкам в Обезьянье человеческого расхо-
димости в экспрессии генов, выбор режима на De Novo
мутации (например, вставок , которые произошли после
расхождения двух видов от а общий
предок) может быть более важным , чем отбор ,
работающих при стоянии вариации INDEL уже существующие в
общих предковых популяций. Этот второй вывод
является контингент на общепринятую предположении , что
темпы транспозиции в организме человека и шимпанзе
примерно равны. В то время как предыдущие анализы генной
экспрессии и белок-кодирующих последовательностей вариации
между шимпанзе и человека выявили закономерно-
крачка в соответствии с нейтральной эволюции и негативной
селекции [31], наши данные согласуются с
гипотезой , что вставкам в целом, и вставках RT в
пределах человек род , в частности, были
положительными движущей силой регулятивной человеческой
эволюции.

Результаты (русский) 3:

хотя более обширные исследования с участием более сэм -когда размеров и многочисленных этапах жизни необходимы для болееточно оценить относительный вклад indels инуклеотиды различия прав шимпанзе различияв экспрессии генов, предварительный анализ представленияв настоящем документе и ранее сообщали khaitovich et al.[31]свидетельствуют о том, что обе категории генетические различия вносятв значительной степени различия в генных выражениймежду двух видов, особенно в яички.тот факт, что большинство людей indel шимпанзевариант, что коррелирует с различиями в ген одежды -сьон объясняется его интересно по двум причинам.во - первых, это соответствует значительный массивданных, свидетельствующих о том, что значительная часть расхождений в джинмнений между шимпанзе и человека, может быть,движущей силой развития механизмов регулирования в рамках ускореннойправ линии [34].наши результаты согласуютсяс предположением о том, что темпы indels(в основном RT вставками) внутри человеческого родатакже может в значительной степени способствовали регулированияразличия между этими двумя видами.во - вторых, наши данныеговорят о том, что, по крайней мере, с точки зрения эволюциивклад indels шимпанзе прав дайвер -gence в экспрессии генов, отбора, действующих на зановомутации (например, прокладки, которые имели место послерасхождения между двумя видами с общейпредок) могут быть более важными, чем выборпостоянный indel изменения в действующие на уже существующихобщих предков населения.второй выводзависит от того, что, как правило, провелперенос ставки в людей и шимпанзе являютсяприблизительно равные.в то время как в предыдущих анализов, джинмнений и кодирования белков изменения последовательностимежду шимпанзе и человека, выявили пэт -в соответствии с нейтральным эволюции и негативные крачкавыбор [31], наши выводы согласуются сгипотеза о том, что indels в целом и RT вставокна правах линии, в частности, былипозитивной движущей силой прав регулирующихэволюция.