LC-ESI-MS and -MS/MS data sets were

LC-ESI-MS and -MS/MS data sets were analyzed for determination of the deamidation level of asparagine/glutamine, oxidation level of methionine and level of N- and C-terminal protein variants. For identified peptides related to a deamidation or oxidation site, extracted ion chromatograms (EIC) were generated in the unmodified state and in the modified (deamidated Asn/Gln, oxidized Met) state. Extracted ion chromatograms (EIC) of peptides related to N- and C-terminus were generated as well. The modification/truncation levels were assigned by comparing the signal intensity of the peaks matching the unmodified/ non-truncated and modified/truncated peptides. The sum of the signal intensities of unmodified/non-truncated and modified/truncated peptides was set to 100%. No correction for different ionization efficacy of the peptides was done; the modification level in percentage does not exactly reflect the amount of the peptide with or without modification.

Результаты (русский) 1:

Наборы данных LC-ESI-МС и МС/МС были проанализированы на предмет определения deamidation уровня аспарагина/глутамин, окисления уровень метионина и вариантов белка N - и C-терминала. Для выявленных пептидов, связанных с deamidation или окисления сайта, извлеченный Ион хроматограм (EIC) были созданы в неизмененном состоянии и в модифицированных (deamidated Asn/Gln, окисленные Met) состояние. Извлеченный Ион хроматограм (EIC) пептидами, связанных с N - и C-terminus были созданы также. Модификация/усечения уровни были заданы путем сравнения интенсивности сигнала пиков, соответствия неизмененных / не усечены и изменения/усечено пептиды. Сумма сигнала интенсивности неизмененные/non усечено и изменение/усечен пептиды был установлен на 100%. Исправления для эффективности различных ионизацией пептидов было сделано; уровень изменения в процентах точно не отражает количество пептид с изменениями или без изменений.

Результаты (русский) 2:

Наборы данных LC-ESI-MS и -MS / МС анализировали для определения уровня деамидированием аспарагина / глутамин, уровень окисления метионина и уровня N- и С-концевых белковых вариантов. Для определенных пептидов, связанных с деамидированием или окисления сайта, извлекаемого ионного хроматограмм (ЭПК) генерировались в неизмененном состоянии и в модифицированном (дезамидированной Asn / Gln, окисленный Met) состояние. Извлекаемого ионного хроматограмм (ЭПК) пептидов, связанных с N- и С-конца были получены, а также. Уровни модификации / усечения были назначены путем сравнения интенсивности сигнала пиков, соответствующих немодифицированных / неусеченной и испорченные / усеченных пептидов. Сумма интенсивностей сигналов немодифицированных / отсечении и измененных / усеченных пептидов был установлен на 100%. не было сделано никакой коррекции для различной ионизационной эффективности пептидов; уровень модификации в процентах не точно отражает количество пептида с модификацией или без нее.

Результаты (русский) 3:

lc-esi-ms и - MS / MS наборов данных, были проанализированы на установление deamidation уровень аспарагин / глютамин, окисления уровень метионин и уровень n - и c-terminal белок вариантов.в отношении выявленных пептиды с deamidation или окисления сайта, добытых ион chromatograms (еиц) были созданы в неизмененном состоянии и в измененной (deamidated асп / джинны, окисленные встретились) государства.из chromatograms ионов (еиц) пептидов, связанных с н - и - концом поступили также.изменение / усечение уровнях были назначены, сравнив сигнал интенсивность пики совпадают с исходной / не усеченная и изменить / усеченная пептидов.сумма сигнал интенсивности исходной / не усеченная и изменить / усеченная пептиды был установлен на 100%.никакой коррекции различных ионизация эффективность пептиды было сделано; изменение уровня в показатель неточно отражает сумму пептиды с или без изменений.