The rise of Systems Biology, seekin

The rise of Systems Biology, seeking to comprehend biological processes as a whole, highlighted the need to not only develop corresponding quantitative models, but also to create standards allowing their exchange and integration. This concern drove the community to design common data format such as SBML and CellML. SBML is now largely accepted and used in the field. However, as important as the definition of a common syntax is, it is also necessary to make clear the semantics of models. SBO is an attempt to provide the means of annotating models with terms that indicate the intended semantics of an important subset of models in common use in computational systems biology.[1][2] The development of SBO was first discussed at the 9th SBML Forum Meeting in Heidelberg Oct. 14–15, 2004. During the forum, Pedro Mendes mentioned that modellers possessed a lot of knowledge that was necessary to understand the model, and more importantly to simulate it, but this knowledge was not encoded in SBML. Nicolas Le Novère proposed to create a controlled vocabulary to store the content of Pedro Mendes' mind before he wandered out of the community.[3] The development of the ontology was announced more officially in a message from Le Novère to Michael Hucka and Andrew Finney on October 19.

Результаты (русский) 1:

Рост биологии, стремясь понять биологические процессы в целом, подчеркнул необходимость не только разработать соответствующие количественные модели, но и для создания стандартов, позволяя их обмена и интеграции. Эта озабоченность вынудили сообщество разработать общий формат данных, таких как SBML и CellML. Теперь SBML основном допускаются и используются в поле. Однако, также важно, как определение общего синтаксиса является, это также необходимо четко семантики моделей. СПО является попыткой предоставить средства для аннотирования модели с терминами, которые указывают предполагаемого семантики важное подмножество модели широко используются в биологии вычислительных систем.V10[2] развитие СПО впервые обсуждался на совещании Форума в 9 SBML в Гейдельберге 14-15 октября 2004 года. В ходе форума Педро Мендес отметил, что для моделистов обладал большим количеством знаний, необходимо разобраться в модели, и более важно, чтобы имитировать его, но это знание не было закодировано в SBML. Николя Ле Novère предложил для создания словаря для хранения содержимого Педро Мендес ума, прежде чем он бродил из сообщества.[3] развитие онтологии было объявлено официально в сообщение от Le Novère Hucka Майкл и Эндрю Финни на 19 октября.

Результаты (русский) 2:

Подъем системной биологии, стремясь понять биологические процессы в целом, подчеркнул необходимость не только развивать соответствующие количественные модели, но и для создания стандартам, что позволяет их обмен и интеграцию. Это беспокойство поехал к сообществу разработать общий формат данных, таких как SBML и CellML. SBML сейчас в основном принята и используется в области. Тем не менее, также важно, как определение общей синтаксиса, необходимо также, чтобы сделать очистить семантику моделей. СБО является попыткой предоставить средства аннотирования модели с точки, которые указывают, предназначенные семантику важного подмножества моделей в общем пользовании в вычислительной системной биологии. [1] [2] Развитие SBO впервые обсуждалась на 9-м SBML форума Встреча в Гейдельберг октября 14-15, 2004. Во время форума, Педру Мендеш отметил, что моделисты обладал много знаний, что было необходимо, чтобы понять модель, и что более важно, чтобы имитировать его, но это знание не было закодировано в SBML. Николя Ле Novère предложил создать контролируемый словарь для хранения содержание виду Педро Мендеса, прежде чем он бродил из общины. [3] Развитие онтологии было объявлено более официально в сообщении от Le Novère Михаилу Hucka и Эндрю Финни 19 октября.

Результаты (русский) 3:

Появление систем биологии, стремясь понять биологические процессы в целом, подчеркнул необходимость не только к разработке соответствующих количественных моделей, но и в том, чтобы создать стандартам, что позволяет их обмена и интеграции. Эта обеспокоенность заставили сообщества по разработке общего формата данных таких как SBML и CellML. SBML сейчас в основном приняты, и в поле. Вместе с тем,Важное значение, как и определение общей синтаксис, необходимо также четко семантики модели. SBO является попыткой предоставить средства для аннотирования модели с точки зрения, указывающих на то, что предназначено семантики важным элементом модели в распространенных в вычислительных системах биология.[ 1] [ 2] в целях развития SBO впервые обсуждался на 9-м SBML форума в Хайдельберге окт. 14-15, 2004 года. В ходе форума, Педро Mendes упомянул о том, что разработчики моделей обладает много знаний, необходимых для понимания модели, и, что более важно для имитации, но это знание не кодируются в SBML.Николас Ле Novère предложил создать контролируемую лексики для хранения содержимого Педро Mendes" до того, как он отступился от сообщества. [ 3] развитие демонстрируя было объявлено более официально в сообщение от Le Novère Майкл Hucka и Эндрю года 19 октября.