This method is based on Chromosome

This method is based on Chromosome Conformation Capture, in which chromatin is crosslinked with formaldehyde, then digested, and re-ligated in such a way that only DNA fragments that are covalently linked together form ligation products. The ligation products contain the information of not only where they originated from in the genomic sequence but also where they reside, physically, in the 3D organization of the genome. In Hi-C, a biotin-labeled nucleotide is incorporated at the ligation junction, enabling selective purification of chimeric DNA ligation junctions followed by deep sequencing. The compatibility of Hi-C with next generation sequencing platforms makes it possible to detect chromatin interactions on an unprecedented scale. This advance gives Hi-C the power to both explore the biophysical properties of chromatin as well as the implications of chromatin structure for the biological functions of the nucleus. A massively parallel survey of chromatin interaction provides the previously missing dimension of spatial context to other genomic studies. This spatial context will provide a new perspective to studies of chromatin and its role in genome regulation in normal conditions and in disease.

Результаты (русский) 1:

Этот метод основан на хромосоме конформации захвата, в котором хроматин является сшитый с формальдегидом, затем усваивается организмом и повторно лигируют таким образом, что только фрагментов ДНК, которые ковалентно связаны между собой продуктов перешнуровки формы. Перевязка продукты содержат информацию не только где они возникли из геномной последовательности, но и где они проживают, физически, в 3D Организации генома. В Привет-C биотин меченых нуклеотидов зарегистрирована на стыке перевязки, позволяя выборочной очистки химерных ДНК лигирование узлов следуют глубокого секвенирования. Совместимость Hi-C с виртуализации платформ следующего поколения позволяет обнаружить хроматина взаимодействий в беспрецедентных масштабах. Это дает заранее Hi-C мощность обоих изучить биофизические свойства хроматина, а также последствия структуры хроматина для биологических функций ядра. Обследование массивно параллельной хроматина взаимодействия обеспечивает ранее пропущенное измерение пространственного контекста для других геномных исследований. Этот пространственный контекст обеспечит новые перспективы исследования хроматина и его роль в регуляции генома в нормальных условиях и в болезни.

Результаты (русский) 2:

Этот метод основан на хромосоме конформационного захвата, в котором хроматин, сшитой с формальдегидом, а затем переваривали и повторно лигировали таким образом, что только фрагменты ДНК, которые ковалентно связаны вместе образуют лигирования продуктов. Продукты лигирования содержат информацию не только там, где они произошли от в геномной последовательности, но и где они проживают, физически, в 3D-организации генома. В Hi-C, биотин-меченых нуклеотидов включена в лигирования перехода, позволяет выполнять выборочное очистку химерных переходов лигирования ДНК с последующей глубокой секвенирования. Совместимость Hi-C с платформами секвенирования следующего поколения позволяет обнаружить хроматина взаимодействий в беспрецедентных масштабах. Это достижение дает Привет-C питании как исследовать биофизические свойства хроматина, а также последствия структуры хроматина для биологических функций ядра. Массовым параллелизмом обзор хроматина взаимодействия обеспечивает ранее отсутствующий аспект пространственного контекста на другие геномных исследований. Это пространственный контекст обеспечит новые перспективы для исследований хроматина и его роль в регуляции генома в нормальных условиях и при болезни.

Результаты (русский) 3:

Этот метод основан на хромосомной апостиль Capture, в которой chromatin представляет собой макромолекулы с формальдегида, а затем перевариваются, и снова с расщепленной геномной таким образом, чтобы только фрагменты ДНК, которые covalently связаны друг с другом форма маточных труб. В маточных труб продукты содержат информацию не только в тех случаях, когда они исходили от в геномной последовательности, но и там, где они проживают, физически,В 3D организации генома человека. В Hi-C, a --с маркировкой нуклеотидного зарегистрирована на перевязку маточных труб перекрестка, позволяя селективной очистки химерой ДНК маточных труб перекрестки, глубокую последовательности. Совместимость Hi-C с следующего поколения последовательность платформ позволяет обнаружить chromatin взаимодействий в беспрецедентных масштабах.Это дает Hi-C питание как изучить биофизические свойства chromatin, а также последствия chromatin структуры биологических функций ядра. В параллельных обследование chromatin взаимодействие обеспечивает ранее пропавших без вести размер пространственном контексте других геномных исследований.В пространственном контексте будет предоставлять новые перспективы для исследований chromatin и его роль в геноме человека регулирование в нормальных условиях и в болезни.