Unexplained CasesThe EIP Encephalit

Unexplained Cases
The EIP Encephalitis Project represents the largest cohort of patients (>5,000) with encephalitis studied to date: >4,000 case-patients were enrolled in the California Encephalitis Project and >700 in the Tennessee Unexplained Encephalitis Project. (Cases at the New York site were enrolled for diagnostic testing only.) Despite the rigorous diagnostic testing algorithm, in approximately half of all cases, no underlying cause for encephalitis was identified. Several factors likely contribute to the frustratingly high proportion of cases that had unidentified pathogens. Foremost is that, for many pathogens other than HSV, PCR of cerebrospinal fluid (CSF) was not an optimal diagnostic test. The high sensitivity of PCR in some instances lead to detection of reactivated viruses in CSF of questionable significance, such as Epstein-Barr virus and human herpesvirus 6. Also, for many organisms, serologic testing was superior to PCR, but antibodies were often not detectable until several weeks after the acute infection, and serum samples from the convalescent period was not always available. Issues related to specimen integrity such as volume, storage, and timing of collection likely contributed to inability to identify a cause in some cases. Finally, it has become increasingly clear that >5% of case-patients in whom encephalitis was presumed to have been caused by an infectious organism actually had autoimmune encephalitis. Retrospective testing of specimens from case-patients with undiagnosed disease in the California Encephalitis Project identified a newly described autoimmune syndrome, termed anti–N-methyl-D-asparate receptor (NMDAR) encephalitis, as the leading cause of encephalitis among patients ≤30 years of age. Our initial supposition that the large proportion of undiagnosed cases might be caused by the presence of undiscovered pathogens does not appear to be the case; independent testing of numerous samples at several research laboratories using multiple different techniques, including next-generation sequencing, did not identify any novel infectious agents.

Результаты (русский) 1:

Необъяснимые случаиThe EIP Encephalitis Project represents the largest cohort of patients (>5,000) with encephalitis studied to date: >4,000 case-patients were enrolled in the California Encephalitis Project and >700 in the Tennessee Unexplained Encephalitis Project. (Cases at the New York site were enrolled for diagnostic testing only.) Despite the rigorous diagnostic testing algorithm, in approximately half of all cases, no underlying cause for encephalitis was identified. Several factors likely contribute to the frustratingly high proportion of cases that had unidentified pathogens. Foremost is that, for many pathogens other than HSV, PCR of cerebrospinal fluid (CSF) was not an optimal diagnostic test. The high sensitivity of PCR in some instances lead to detection of reactivated viruses in CSF of questionable significance, such as Epstein-Barr virus and human herpesvirus 6. Also, for many organisms, serologic testing was superior to PCR, but antibodies were often not detectable until several weeks after the acute infection, and serum samples from the convalescent period was not always available. Issues related to specimen integrity such as volume, storage, and timing of collection likely contributed to inability to identify a cause in some cases. Finally, it has become increasingly clear that >5% of case-patients in whom encephalitis was presumed to have been caused by an infectious organism actually had autoimmune encephalitis. Retrospective testing of specimens from case-patients with undiagnosed disease in the California Encephalitis Project identified a newly described autoimmune syndrome, termed anti–N-methyl-D-asparate receptor (NMDAR) encephalitis, as the leading cause of encephalitis among patients ≤30 years of age. Our initial supposition that the large proportion of undiagnosed cases might be caused by the presence of undiscovered pathogens does not appear to be the case; independent testing of numerous samples at several research laboratories using multiple different techniques, including next-generation sequencing, did not identify any novel infectious agents.

Результаты (русский) 2:

Необъяснимые случаи
энцефалита проекта EIP представляет самую многочисленную когорту пациентов (> 5000) с энцефалитом учился на сегодняшний день:> 4000 Тематические пациентов были зачислены в энцефалита проекта Калифорнии и> 700 в Необъяснимая энцефалита проекта Теннесси. (Случаев на сайте New York были зачислены только диагностического тестирования.) Несмотря на строгий диагностического алгоритма тестирования, примерно в половине всех случаев, не основная причина энцефалита выявлено не было. Несколько факторов вероятно вносят вклад в удручающе большой доле случаев, которые имели неопознанных патогенов. Прежде всего в том, что для других, чем ВПГ, ПЦР цереброспинальной жидкости (CSF) многих патогенов не оптимальный диагностический тест. Высокая чувствительность ПЦР в некоторых случаях привести к обнаружению вирусов реактивированных в спинномозговой жидкости сомнительного значения, таких как вирус Эпштейн-Барра и вирус герпеса человека 6 Кроме того, для многих организмов, серологических тестирование превосходит ПЦР, но антитела были обнаружены часто не до нескольких недель после острой инфекции, и образцов сыворотки от выздоравливающих период не было не всегда доступны. Вопросы, связанные с образца целостности, такие как объем, хранения и сроков сбора вероятно, способствовало невозможности определить причину в некоторых случаях. Наконец, она становится все более ясно, что> 5% тематических пациентов, у которых был энцефалит, предположительно, было вызвано инфекционным организма на самом деле было аутоиммунный энцефалит. Ретроспективный тестирование образцов из тематических больных с невыявленной болезни в Калифорнии энцефалита проекта определили недавно описанный аутоиммунного синдрома, называемого анти-N-метил-D-аспартата (рецептор NMDAR) энцефалит, как ведущей причиной энцефалита среди больных ≤30 лет от возраста. Наша первоначальная гипотеза, что большая часть диагностированных случаев может быть вызвано наличием неоткрытых патогенов, кажется, не быть в случае, независимое тестирование образцов многочисленных в нескольких научно-исследовательских лабораторий, использующих несколько различных методов, в том числе следующего поколения секвенирования, не было выявлено новых инфекционных агентов.

Результаты (русский) 3:

необъяснимыми случаями
The энн энцефалит проект является крупнейшей группе пациентов (более 5000) с энцефалит учился на сегодняшний день: > 4000 случае пациенты поступили в калифорнии энцефалит и проекта > 700 в теннесси необъяснимых энцефалит проекта.(дела в нью - йорке сайт поступили на диагностическое тестирование только.), несмотря на строгий диагностическое тестирование алгоритм,примерно в половине всех случаев, нет причин для энцефалита не нашлось.несколько факторов, которые могут способствовать удручающе большое число дел, по которым были неустановленные патогенов.в первую очередь, заключается в том, что для многих микроорганизмов, помимо впг, пцр спинномозговой жидкости (рсу) не является оптимальной диагностический тест.высокой чувствительности пцр в некоторых случаях привести к обнаружению возобновлена вирусов в спинномозговой жидкости сомнительного значения, такие как вирус эпштейна - барр и прав herpesvirus 6.также, для многих организмов, серологических тестов была выше пцр, но антитела, зачастую не обнаружить лишь спустя несколько недель после острой инфекции,и образцов сыворотки от восстановления период не всегда имеются в наличии.вопросы, связанные с образец целостности, таких как объем, хранения и сроков сбора данных, скорее всего, способствовала неспособность определить, потому что в некоторых случаях.и наконец,